Située au rez-de-chaussée dans le prolongement de l'exposition La nature dans tous ses états, la salle consacrée à l'horlogerie accueille un choix de montres et d'horloges anciennes, principalement de la région de Neuchâtel. Elle comporte notamment des pièces de Ferdinand Berthoud et d'Abraham-Louis Breguet, ainsi que des pièces richement décorées à l'émail.