A signaler que l'Esplanade devant le musée, créée en 1994 à l'occasion de l'agrandissement de l'Hôtel Beaulac, situé en face, nous a donné la possibilité d'aménager un jardin de sculptures qui, comme le reste de la collection, confronte oeuvres des sculpteurs régionaux à celles d'autres artistes suisses ou étrangers.
Nouvel accrochage dans la salle des grands formats du 19e siècle où l'on retrouve maintenant Le départ des pêcheurs par Léopold Robert mais aussi une nouvelle acquisition d'un grand tableau de Günther Förg dans la salle de l'art d'aujourd'hui.
À l'étage du musée, dans la première salle côté est se trouve le clavecin Ruckers, du nom de son créateur anversois du 17e siècle.
Au centre de la salle consacrée à l'horlogerie se trouvent les trois Automates Jaquet-Droz, qu'il est possible d'admirer à l'œuvre lors des démonstrations publiques, accessibles sans réservation, et qui ont lieu le premier dimanche de chaque mois à 14h, 15h et 16h ou sur réservation.
Située au rez-de-chaussée dans le prolongement de l'exposition La nature dans tous ses états, la salle consacrée à l'horlogerie accueille un choix de montres et d'horloges anciennes, principalement de la région de Neuchâtel.
Située sur la galerie du rez-de-chaussée, en enfilade de la salle consacrée à la verrerie, la salle de la Collection Strubin expose quelques-unes des pièces majeures de cet ensemble prestigieux de plus de 400 pièces consacrées aux armes et équipements des armées françaises de 1790 à 1870 environ.
Après une campagne de restauration, la majeure partie de cette collection notamment d'impressionnistes français est présentée dans un nouvel accrochage dans l'entresol de l'aile est du musée.
Pour accompagner les festivités du Millénaire, le Musée d’art et d’histoire présente une importante exposition consacrée à l’histoire fascinante de la ville de Neuchâtel. Tout en tissant des liens avec l’époque actuelle, l’exposition interroge les rapports qu’a entretenus Neuchâtel avec sa région et le monde. Elle amène le visiteur dans la mouvance de l’histoire, à travers un parcours thématique surprenant et une sélection remarquable d’objets, d’images, de films, de bornes interactives et de jeux. Une visite riche en découvertes pour petits et grands qui permet de voir autrement l’histoire.