Die Sammlung von Medaillen und von zu ihrer Herstellung verwendeten Werkzeuge umfassen mehrere tausend Objekte. Die Medaillen mit Neuenburger Themen bilden ein bedeutendes Ensemble, welches durch den reichen Bestand von Werken sowie Skizzen und Entwurfszeichnungen von Neuenburger Medailleuren vervollständigt wird.

Das MahN besitzt zudem ein lokales industrielles Erbe von einzigartigem Wert der Medailleure Huguenin aus Le Locle und Paul Kramer aus Neuenburg. In dieser Sammlung finden sich Modelle aus Kupfer und Harz, Mutterstempelmatrizen und Stempel, aber auch ein Balancierer (Stosswerk) und eine Reduktionsmaschine, welche die Methoden zur Herstellung von Medaillen im frühen 19. bis Anfang 20. Jahrhundert beleuchten. Bestellregister und nach "Produkten" geordnete Karteien, Referenzsammlungen von Medaillen und diverse Papier - und Fotoarchive veranschaulichen die Geschichte dieser beiden international renommierten Neuenburger Betriebe und dokumentieren die Erneuerung der Medaille, zu der sie entscheidend beigetragen haben.